一、两者的基本属性不同。强制性社会医疗保险是公益性福利事业，带有强制性，各类用人单位必须依法参加该项保险。商业性医疗保险属于商业性质，不带有强制性。
二、两者的保险范围不同。前者的保险范围较广，不仅保“大病”，而且保“小病”，不仅对参保人的住院费用给予一定补偿，而且对其门诊费用也给予一定补偿。而后者的保险范围相对较小，一般只对其承保范围内的疾病的住院费给予一定金额的补偿。
三、两种保险制度给予参保人的保险待遇不同。前者一般按照医疗费的一定比例给予补偿，数额具有不固定性，不完全以个人缴纳的保险费用为准，具有社会救济的性质;而后者则一般按照一定金额补偿，补偿金额具有固定性或者一定范围，该保险是保险公司根据保险的大数原则来具体操作的，具有商业性的救济性质。
