李登辉7月30日晚间病亡，和中国国民党间的恩怨情仇也正式画下句点。李曾以国民党籍的身份担任台湾地区领导人12年，更曾任国民党主席12年，但后来因为李转变了路线，和国民党分道扬镳。2001年9月21日，国民党撤销李登辉党籍，这是国民党成立107年来首次对前主席给予党纪处分，意味着国民党与李登辉彻底决裂。
时任国民党主席的李登辉，和连战等副主席的合照
李登辉从美国康奈尔大学获得农经博士学位回到台湾后，成为大学教授，经友人推荐，被当时正积极延揽“台籍精英”的国民党吸收入党。1971年8月，李登辉正式加入国民党。
李登辉加入国民党后，第二年即出任“行政院政务委员”，1978年起任台北市长，1981年起任“台湾省政府主席”，1984年被蒋经国选中当“副总统”；蒋经国病逝后，李登辉于1988年接任“总统”、国民党主席，成了国民党党政最高职位的人，且长达12年。
李登辉在权力逐渐巩固后，提出“国民党是外来政权”，开始推行“本土化”路线，将反对的“非主流派”清出党，且开始扶持民进党，让民进党势力日益壮大。2000选举国民党惨败，拱手让出长达半世纪的“执政权”，对于民进党和陈水扁的获胜，时任国民党主席的李登辉表示，很高兴实现了“政权和平转移”！此番话惹怒的国民党支持者，众人围住国民党中央党部，要求李辞职。该年3月24日，李登辉宣布提前辞去国民党主席一职，由连战代理，终结了李登辉在国民党12年的领导。
在连战的主导下，国民党开始逐渐抛弃“李登辉路线”，李连之间、李登辉与国民党之间渐行渐远。
而李登辉也开始和“台独”势力靠拢，往“台湾之父”的目标迈进，更打出“本土化”旗号，为自己寻找新的政治舞台。在李登辉的授意下，成立了新政党“台湾团结联盟”，当时仍为国民党籍的李，更到处为台联的“立委”提名人”站台助选，且猛力炮轰国民党。
马英九执政时也曾拜会李登辉
国民党历史照片都可以看到李登辉主持会议的身影
因此开除李登辉的声音，开始在国民党响起，当时连战和国民党中央担心处分李登辉将可能冲击到国民党。但随着李登辉对国民党批判越来越重，国民党不得不处理李登辉的问题。最终在2001年9月21日，国民党考纪会举行会议，确认李登辉已经严重违反了党章规定，决议撤销其国民党籍。且因对李前主席的尊重，考纪委员会在4项党纪处分中选择第三重的“撤销党籍”，而非最严厉的“开除党籍”。但也正式宣告国民党和李登辉的分道扬镳。
在李登辉病亡后，国民党7月30日发出简短的声明，提到“感谢李登辉给予大家的人生启发，他一生功过后自有评断，希望李安息，期盼家属节哀。”总结了国民党和李登辉之间的连结。
