轨道交通是2021年北京交通综合治理的重点，据北京交通发展研究院规划所主任工程师孙玲介绍，今年，交通部门将加快推进轨道交通四网融合发展，推动与铁路部门签订路地战略合作框架协议，研究完成四网融合顶层设计，打造“一套体系、一网运营、一票通行、一站安检”。推进城市副中心线、东北环线、通密线等市郊铁路整体提升工程，推进S2线南段（黄土店-南口）通勤化改造，为市民提供通勤多样化选择。研究市郊铁路与轨道线路交叉处增加换乘站方案，并组织实施。
在轨道交通线网建设方面，今年将实现7条段、54.5公里的开通试运营目标，涉及8号线三期剩余段（中国美术馆-珠市口）、11号线西段（金顶街-首钢）、14号线剩余段（西局-右安门外）、17号线南段（十里河-亦庄站前区南）、19号线一期（新宫-牡丹园）、机场线西延（东直门-北新桥）、S1线剩余段（金安桥-苹果园）。3号线一期、12号线、17号线等在施线路也将加紧建设。同时，推动既有轨道线网优化提升，实现1号线和八通线、房山线和9号线跨线运营。
此外，还将不断提升轨道交通的运营服务水平，在天通苑、天通苑北、天通苑南、霍营、回龙观东大街等站推出基于乘客信用体系的安检新模式，提高安检质量和效率，实现乘客快速进站。打造第一批71个城市活力微中心，加快在轨道交通车站设置便利店、书店、自动体外除颤仪（AED）等便民增值服务。
